藏医历算院（门孜康）的主要目的是为了保存，推广和实践藏医药和天文历算学的传统理论体系,提高广大民众的卫生保健知识，为了所有的人不分国籍，信仰和肤色，提供方便的医疗服务，促进人们的身心健康，特别关爱难民的健康与生存。建立药房和门诊，培养具有高等教育水平的学者，继承和发展藏医药和天文历算学，同时，与印度和国外的医疗机构合作；通过医疗、演讲和展览等学术活动，宣传和发扬具有高原民族特色的传统藏医药理论体系。